A CEFIS tem como missão implementar, desenvolver, consolidar e expandir os serviços da área de saúde de modo transformador e de excelência, com vistas à prevenção, diagnóstico, tratamento e reabilitação de clientes, através da ação conjunta de profissionais qualificados, empreendedores e éticos, a fim de promover o desenvolvimento humano e social, bem como a prestação de consultoria educacional na área de saúde. 

A CEFIS desenvolve sua Missão alicerçada nos seguintes valores e princípios:

• Compromisso com a Saúde de excelência;

• Compromisso com a Inclusão e a justiça social;

• Compromisso com a promoção da igualdade étnico-racial;

• Respeito aos direitos humanos;

• Respeito ao meio ambiente;

• Estímulo e incentivo ao empreendedorismo;

• Promoção de valores éticos;

• Valorização do mérito acadêmico.